La flora intestinal, o microbiota intestinal, es el término para todos los microorganismos que se asientan en el intestino. En los bebés, la flora intestinal debe primero asentarse y desarrollarse. Varios estudios indican que la colonización del intestino ya comienza en el útero. La flora intestinal de un bebé cambia con el tiempo. La flora intestinal saludable es una base importante para la salud general. Por lo tanto, las bacterias intestinales buenas (como las bifidobacterias, los lactobacilos) son importantes para combatir las bacterias patógenas. De esta manera, se pueden evitar las infecciones. Además, la flora intestinal apoya el desarrollo del sistema inmunológico, que aún es inmaduro al nacer.